Kazetové filtre sa zvyčajne používajú v doplňovacom vzduchu alebo v recirkulačných jednotkách ako konečný stupeň HEPA na ochranu koncových filtrov HEPA v čistých priestoroch. Môžu sa používať v najnáročnejších prostrediach od potravinárstva cez farmaceutický priemysel až po výrobu mikroelektroniky.